Az Anime School Animal Simulator egy anime 3D-s akciójáték yandere és RPG elemekkel, egy iskolában játszódik. A főszereplő, Ayano egy tipikus yandere karakter, aki csak azért érkezik az iskolába, hogy felfedezze, hogy a rendes diákok helyett mutáns állatokkal áll szemben. Ezek a mutánsok egykor az osztálytársai voltak, most pedig meg kell küzdenie velük, fel kell fedeznie az iskolát, fel kell tárnia a titkokat, és meg kell találnia a módját, hogy visszaállítsa barátait normális formájukba.
Ayanónak nemcsak meg kell küzdenie a mutánsokkal, hanem meg kell mentenie barátait a további fertőzéstől, és meg kell találnia a módját a mutáció terjedésének megállítására. A játék során felfedi a mutánsok mögött rejlő rejtélyt, és megoldást keres ennek a félelmetes jelenségnek a megállítására. A játék 15 szintet tartalmaz, amelyek mindegyike tele van akciókkal, rejtvényekkel és főnöki csatákkal.
A játékosoknak fegyvereket és ruházatot kell vásárolniuk, amelyek védelmet nyújtanak és javítják Ayano képességeit, segítve a túlélést ebben a veszélyes helyzetben. A ruházat és a fegyverek kulcsfontosságúak a mutánsokkal és erős főnökökkel vívott csatákban. A játék felfedezőelemeket is tartalmaz, ahol Ayanónak az iskola különböző részein kell keresnie, hogy nyomokat és megoldásokat találjon a problémára.
Ayano találkozik szerelmével, Taróval is, és az iránta érzett érzelmei egyre intenzívebbé és veszélyesebbé válnak, és yandere-elemeket ad a történethez. Ayano a játék során végig küzdeni fog érzelmeivel és Taróhoz való ragaszkodásával, mivel az iránta érzett szerelme nem csak önmagára, hanem a körülötte lévőkre is veszélyt jelenthet.
Az Anime School Animal Simulator az anime, a yandere, az iskolai szimuláció és az RPG elemeit ötvözi, egyedülálló történetet kínálva a játékosoknak, ahol nemcsak mutánsokkal harcolnak és titkokat tárnak fel, hanem megpróbálják megmenteni barátaikat és megállítani egy pusztító fertőzés terjedését.